Después de graduarse del Seminario Teológico Talbot, John llegó a Grace Community Church en 1969.
El énfasis de su ministerio desde el púlpito es el estudio cuidadoso y la exposición versículo por versículo de la Biblia, con especial atención a los antecedentes históricos y gramaticales detrás de cada pasaje. Bajo el liderazgo de John, los dos servicios de adoración matutinos de Grace Community Church llenan el auditorio. Varios miles de miembros participan cada semana en docenas de grupos de confraternidad y programas de capacitación, la mayoría dirigidos por líderes laicos quienes se dedican a preparar a los miembros para el ministerio a nivel local, nacional e internacional.
En 1985, John se convirtió en presidente de The Master’s College (anteriormente Los Angeles Baptist College; desde 2016, The Master’s University). Ubicada en Santa Clarita, California, es una institución de artes liberales acreditada y claramente cristiana que ofrece programas de licenciatura y posgrado. En 1986, John fundó The Master’s Seminary, una escuela de posgrado dedicada a capacitar a hombres para el trabajo pastoral y misionero de tiempo completo. Ahora se desempeña como rector emérito de la Universidad y el Seminario.
John también es presidente y profesor destacado de Grace to You. Fundada en 1969, Grace to You es la organización sin fines de lucro responsable de desarrollar, producir y distribuir los libros de John, los recursos de audio y los programas de radio y televisión de Grace to You. Los audios de Grace to You se transmiten más de mil veces al día en todo el mundo de habla inglesa y llega a los principales centros de población con la verdad bíblica. También se transmite más de mil veces al día en español, llegando a veintisiete países de Europa y América Latina. Los videos de Grace to You se transmiten semanalmente por DirecTV en los Estados Unidos y está disponible de forma gratuita en Internet en todo el mundo. Los más de 3300 sermones de John, que abarcan más de cinco décadas de ministerio, están disponibles para su descarga gratuita.
John ha escrito cientos de guías de estudio y libros, incluyendo El evangelio según Jesús, Nuestra suficiencia en Cristo, Fuego extraño, Avergonzado por el Evangelio, El asesinato de Jesús, El hijo pródigo, Doce hombres comunes y corrientes, La guerra de la verdad, El Jesús que No puedes ignorar, Esclavo, Una vida perfecta, El evangelio según Pablo, Parábolas y Una vida fiel, entre otros libros. Los libros de John se han traducido a más de dos docenas de idiomas. La Biblia de estudio MacArthur, el recurso fundamental de su ministerio, está disponible en inglés (NKJ, NAS y ESV), español, ruso, alemán, francés, portugués, italiano, árabe y chino. En 2015, se completó The MacArthur New Testament Commentary. En treinta y cuatro volúmenes, John lleva a los lectores detalle por detalle, versículo por versículo, a través de todo el Nuevo Testamento.
John y su esposa, Patricia, viven en el sur de California y tienen cuatro hijos casados: Matt, Marcy, Mark y Melinda. También disfrutan de la emocionante compañía de sus quince nietos.
